Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp19Q3UJD6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp19Q3UJD6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms