Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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