Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arfgef3Q3UGY8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arfgef3Q3UGY8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms