Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms