Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms