Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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