Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rnf180Q3U827 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf180Q3U827 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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