Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc9Q3U0M1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms