Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hhla1Q3TYV2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms