Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccndbp1Q3TVC7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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