Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc136Q3TVA9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc136Q3TVA9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms