Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdnep1Q3TP92 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdnep1Q3TP92 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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