Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc10Q3TLI0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc10Q3TLI0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms