Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Colec11Q3SXB8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec11Q3SXB8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec11Q3SXB8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec11Q3SXB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec11Q3SXB8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Colec11Q3SXB8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms