Protein–RNA interactions for Protein: Q32NZ6

Tmc5, Transmembrane channel-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc5Q32NZ6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmc5Q32NZ6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmc5Q32NZ6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms