Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hdgfl1Q2VPR5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hdgfl1Q2VPR5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms