Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrna5Q2MKA5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms