Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam178bQ24JP3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fam178bQ24JP3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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