Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Samd11Q1RNF8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Samd11Q1RNF8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms