Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ptchd1Q14B62 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ptchd1Q14B62 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ptchd1Q14B62 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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