Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Traf3ip1Q149C2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Traf3ip1Q149C2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Traf3ip1Q149C2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Traf3ip1Q149C2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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