Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms