Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms