Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q08AU9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q08AU9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q08AU9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q08AU9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q08AU9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q08AU9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms