Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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