Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou6f1Q07916 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms