Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MestQ07646 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MestQ07646 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MestQ07646 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MestQ07646 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MestQ07646 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MestQ07646 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MestQ07646 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms