Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col17a1Q07563 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col17a1Q07563 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col17a1Q07563 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms