Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AmbpQ07456 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms