Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah1bQ06985 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah1bQ06985 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms