Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox4Q06831 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms