Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh3bp2Q06649 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp2Q06649 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms