Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mex3cQ05A36 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mex3cQ05A36 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms