Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr16c6Q05A13 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sdr16c6Q05A13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms