Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox9Q04887 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms