Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms