Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nf1Q04690 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms