Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RelaQ04207 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RelaQ04207 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms