Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn6Q03958 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms