Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scg2Q03517 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scg2Q03517 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms