Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb4Q02738 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gjb4Q02738 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms