Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdcd1Q02242 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcd1Q02242 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms