Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RykQ01887 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RykQ01887 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RykQ01887 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RykQ01887 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RykQ01887 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms