Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VcpQ01853 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VcpQ01853 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VcpQ01853 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms