Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Hoxd1Q01822 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms