Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SelpQ01102 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SelpQ01102 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms