Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2cQ01098 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms