Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb2Q00977 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms