Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VegfaQ00731 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms