Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga4Q00651 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms